Die Gemeinde Loulé hat zwei weitere lokale Naturschutzgebiete offiziell ausgewiesen: die Reserva Natural Local da Nave do Barão und das Monumento Natural Local da Gruta de Vale Telheiro.
Die Nave do Barão umfasst rund 788 ha in den Gemeinden Salir und Tôr und ist Teil des Natura-2000-Netzes sowie des Geoparque Algarvensis. Das karstische Polje besitzt nationale geologische Bedeutung und beherbergt mehrere prioritäre Lebensräume, darunter eines der größten temporären mediterranen Feuchtgebiete Portugals.
Die Gruta de Vale Telheiro in São Sebastião erstreckt sich über 78,52 ha und gilt als bedeutender Hotspot unterirdischer Biodiversität. Dort wurden mehr als 25 an das Höhlenleben angepasste Tier-Arten nachgewiesen, darunter weltweit einzigartige Endemiten.
Mit dem neuen Schutzstatus erhält Loulé rechtliche Instrumente zur Abgrenzung von Schutzzonen, zur Einschränkung naturbelastender Nutzungen und zur Umsetzung von Erhaltungsmaßnahmen. Nach Angaben der Stadtverwaltung stärkt die Gemeinde damit ihre Umweltstrategie und festigt ihre Position im nationalen Netz geschützter Flächen.
Weitere lokale Schutzgebiete sind Rocha da Pena, Fonte Benémola sowie die Reserva Natural Local da Foz do Almargem e do Trafal.